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基于Eam1105Ⅰ酶切的p18K-T载体的构建
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：TA克隆是PCR产物克隆最简单的方法,而T载体的改良对提高TA克隆效率、简化克隆片段后续的酶切、连接等实验步骤有着十分重要的意义.本研究以pMD18-T载体为基础,将原有的氨苄青霉素抗性筛选标记基因替换成卡那霉素抗性筛选标记基因,克服了原载体筛选抗性(氨苄青霉素)容易失活的问题,并在原有酶切位点的基础上增加了NsiⅠ、BsaⅠ、BglⅡ、NheⅠ和AclⅠ五个酶切位点,方便了克隆片段后续的酶切和连接操作,同时在XbaⅠ和BglⅡ之间引入了两个Eam1105I限制性核酸内切酶位点,构建成一个环状中间载体p18KT-M.利用Eam1105I酶切中间载体p18KT-M可以制备3'端带有T尾的线性化p18K-T载体.经TA克隆验证,p18K-T载体连接PCR产物的效率与原pMD18-T载体的效率相当.
关键词： TA克隆 pMD18-T载体 p18K-T载体 Eam1105Ⅰ限制性核酸内切酶
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水稻白条纹叶突变体wsl1的遗传分析及基因精细定位
《作物学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：从粳稻日本晴和籼稻R1128杂交衍生的重组自交系群体中获得一个稳定遗传的白条纹叶突变体wsl1(white stripe leaf 1),世代为F10.与亲本R1128相比,突变体wsl1表现出白条纹叶,同时叶脉呈现白化,该性状在苗期就出现并持续整个生育期;突变体的株高、每穗总粒数、剑叶长、生育期显著增加,而结实率显著下降,其他农艺性状没有显著变化.分蘖期突变体wsl1的叶绿素a、叶绿素b和胡萝卜素含量较杂交亲本R1128显著下降;透射电镜观察表明,与野生型相比,突变体的叶绿体形状异常,不规则.遗传分析表明,该突变性状由1对隐性核基因控制.精细定位后发现,目标基因WSL1位于第1染色体短臂上标记M1-54与标记M1-70之间,两者相距89.7 kb.生物信息学分析表明候选区间内共有8个开放阅读框,暂未发现已报道的叶色相关基因;其中LOC_Os01g02080编码肽基脯氨酰顺反异构酶,GO(Gene Ontology)分类显示其可能与类囊体形成有关,后续将通过比较测序、qRT-PCR等分子实验来确定候选基因.
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水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：转录因子NF-YB (nuclear factor-YB)家族是核因子Y (nuclear factor Y, NF-Y)家族的一个亚家族,在调控胚发育、形态建成、开花时间、株高、穗粒数等方面,尤其是在非生物胁迫应答中发挥着重要的作用。为揭示水稻NF-YB基因家族的信息及特征,加快基因家族功能挖掘进程,本研究利用生物信息学手段对该基因家族及其编码蛋白进行分析。结果表明,水稻中共有13个NF-YB基因,在染色体上分布不均匀,所编码的蛋白都定位在细胞核,且不含跨膜结构域或信号肽。多重序列比对,二级结构,三级结构以及基序分析表明,该家族成员保守性较高,均含有高度保守的CBF/NF-Y结构域。进化分析表明NF-YB家族基因的分化早于物种的分化。磷酸化位点和互作蛋白网络分析初步预测了家族成员的互作蛋白网络。本研究为后期NF-YB家族成员的功能研究,加快家族基因的实际应用进程提供了帮助。
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